Американские исследователи изучали пробы воды, собранные у побережья Калифорнии. Они анализировали всю ДНК окружающей среды (eDNA), выделенную из образцов. Новый метод, получивший название «метабаркодирование», позволил точно определить виды микроорганизмов и оценить их количество. Результат исследования опубликованы в журнале Nature Communications.
Ученые из Института океанографии Скриппс в Калифорнийском университете в Сан-Диего, Института Крейга Вентера и Национального управления океанических и атмосферных исследований США использовали методы генетического анализа, аналогичные тем, которые используются в генеалогических исследованиях, для оценки биоразнообразия у побережья Калифорнии. Новая технология, получившая название «метабаркодирование», использует ДНК окружающей среды (eDNA), которая свободно плавает в толще воды. Она позволяет исследовать пищевые цепи океана и оценивать последствия изменений климата.
«Это метод отбора проб будущего, — говорит первый автор исследования Чейз Джеймс. — Наше исследование представляет собой первое применение этого подхода в контексте долгосрочного отбора проб».
Ученые исследовали всю ДНК, обнаруженную в образцах морской воды, чтобы определить микроорганизмы в образцах и оценить их количество. Результаты исследования позволили составить точную карту количества и распределения микроорганизмов у поверхности воды вблизи побережья Калифорнии.
Авторы выяснили, что доступность питательных веществ определяет профиль микроорганизмов в большей степени, чем температура. Такой вывод нельзя было бы сделать, используя только традиционные методы, такие как световая микроскопия, которая позволяет определить виды-индикаторы или измерить концентрацию некоторых значимых молекул, например хлорофилла. Предыдущие технологии исследования морского биоразнообразия давали только общую информацию, тогда как метабаркодирование позволяет точно определять виды и получать огромные объемы данных.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
