Ученые из Великобритании и США разработали новый вычислительный подход, позволивший проанализировать данные о геномах 5 тысяч видов млекопитающих и построить наиболее точное эволюционное древо. Авторы впервые смогли доказать, что плацентарные млекопитающие появились уже после мел-палеогенового массового вымирания, уничтожившего динозавров. Статья опубликована в журнале Nature.
Огромные наборы геномных данных представляют собой ключ к пониманию эволюции видов. Однако их анализ может занимать очень много времени и требует больших вычислительных мощностей. Теперь команда ученых под руководством Лондонского университета королевы Марии, Бристольского университета и Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе разработала новый вычислительный подход для получения точно датированных эволюционных деревьев.
С его помощью авторы ответили на давний вопрос о том, когда возникли современные группы плацентарных млекопитающих — до или после мел-палеогенового массового вымирания. Оно произошло 66 млн лет назад и стерло с лица земли 70% всех видов. Среди них были и динозавры. Результаты работы подтвердили, что предки современных плацентарных появились уже после мел-палеогенового вымирания.
Эволюция млекопитающих оставалась одной из самых спорных тем в эволюционной биологии. Ранние исследования предполагали, что современные группы плацентарных образовались еще в меловом периоде, до вымирания.
Авторы работы проанализировали генетические данные 5 тысяч видов, в том числе 72 полных генома. Новый метод основан на байесовском подходе к анализу большого количества геномных последовательностей генома и на учете неопределенностей в данных. Ученые смогли сократить время вычислений, которое потребовалось бы на подобное исследование, с десятилетий до месяцев. Метод может быть использован и для решения других проблем эволюции, требующих анализа больших наборов данных.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
